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생쥐 데스페로는 커다란 귀에 눈을 뜬 채로 태어납니다. 또한 보통 생쥐들이 흥미를 갖는 일에 전혀 관심이 없습니다. 데스페로는 아름다운 음악 소리에 이끌려 자기도 모르게 인간들에게 모습을 드러내고 마침내 공주와 사랑에 빠집니다.

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인간의 손길을 허락한 사실이 알려지고, 데스페로는 결국 들쥐들이 살고 있는 지하감옥으로 보내지는 벌을 받게 됩니다. 그러나 데스페로의 아버지, 어머니, 형제 어느 누구도 데스페로를 보호해주지 못하며 오히려 매정하게 배신합니다. 아버지는 데스페로에게 벌을 주기 위해 회의를 소집하고, 어머니는 단 한마디 “잘가라”고 말하며 형은 데스페로를 지하감옥으로 밀어넣습니다.

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지하감옥 밑에서 데스페로는 그레고리라는 간수를 만나게 됩니다. 미로 같은 지하감옥에서 그레고리가 살아남는 방법은 오로지 발목에 묶어놓은 밧줄뿐입니다. 그레고리는 데스페로가 이야기를 해주면 지하감옥에서 나가게 해주겠다고 약속합니다.

로스쿠로는 지하감옥에서 살고 있는 들쥐들 가운데 하나입니다. 로스쿠로는 그레고리의 밧줄을 갉아내다가 성냥불빛을 보게 되고 그 후로 밝은 빛에 매혹됩니다. 또 다른 들쥐인 보티첼리는 로스쿠로에게 지하감옥에 갇힌 죄수에게 고통을 주는 일이 삶의 목적이라고 말합니다.

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로스쿠로는 죄수에게 고통을 주지만 기쁨을 느끼지 못합니다. 로스쿠로는 마침내 밝은 빛에 이끌려 화려한 파티가 열리고 있는 연회장으로 들어갑니다. 그러나 공주에게 들키고, 왕비는 그 자리에서 사망합니다. 왕은 모든 쥐를 죽이라고 명령하고 수프와 관련된 모든 물건의 사용을 금지합니다. 로스쿠로는 자신을 경멸의 눈으로 쳐다본 공주에게 복수를 결심합니다.

여섯 살 때 엄마를 잃은 미그는 아빠 때문에 노예로 팔려 심한 학대를 당합니다. 어느 날 왕실 가족의 행차를 보게 된 미그는 자신도 공주가 되겠다는 희망을 품습니다.

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엄마가 죽은 뒤 아빠는 딸 미거리 소우를 엉클이라는 사람에게 팔아버립니다. 미거리 소우는 엉클에게 온갖 학대를 당하지만 언제가 공주가 되고 싶다는 꿈을 갖지요. 다행이도 미거리 소우는 왕의 명을 받아 스프와 관련된 물건들을 수거하던 병사에 의해 공주가 살고 있는 성으로 들어가게 됩니다. 그뒤 그레고리라는 간수에게 식사를 나르는 일을 맡게 되고, 거기서 공주에 대한 복수를 꿈꾸고 있는 로스쿠로를 만납니다. 미거리 소우는 공주가 되게 해주겠다는 로스쿠로의 꼬임에 넘어가 복수의 도구로 전락합니다.